Nel 1995 (D.L. n.32/1995) è stata introdotta la figura del Commissario ad acta per la gestione delle attività ex Agensud trasferite al Ministero delle Politiche Agricole e Forestali (MIPAF).

Con la soppressione dell'Intervento Straordinario nel Mezzogiorno ad opera del D.Lgs.96 del 1993 sono state trasferite al Ministero dell'Agricoltura, ora Ministero delle Politiche Agricole, Alimentari e Forestali, le competenze in materia di acque irrigue ed invasi strettamente legati all'agricoltura (n. 1080 progetti di opere pubbliche irrigue per un valore di 510 milioni di euro).

Nel 1995, con il D.L.n.32/1995, fu prevista la figura del Commissario ad acta per la gestione delle attività ex Agensud trasferite al MIPAF e sono state altresì trasferite le ulteriori competenze in materia di incentivi per le opere private nel settore della valorizzazione dei prodotti agricoli, progetti speciali promozionali, mezzogiorno interno, forestazione produttiva, agrumicoltura, zootecnia, commercializzazione dei prodotti agricoli, ecc. (n. 3016 iniziative per un valore di 229 milioni di euro).

In aggiunta alle suddette competenze relative alle iniziative avviate dal soppresso Intervento Straordinario, Cassa per il Mezzogiorno (Casmez) e successivamente Agenzia per la promozione dello sviluppo del mezzogiorno (Agensud), la legge 341 del 1995 ha stabilito che per i nuovi interventi infrastrutturali irrigui nelle aree depresse del Paese, provvede il Commissario ad acta del MIPAF, sulla base di programmi approvati dal CIPE.  Ai sensi di tale norma, sono stati avviati diversi programmi di opere irrigue di rilevanza nazionale per oltre 70 lavori nelle Regioni Abruzzo, Molise, Campania, Basilicata, Puglia, Calabria, Sicilia e Sardegna, per complessivi 1040 milioni di euro.

Il CIPE, con diverse delibere, ha inoltre assegnato al Commissario ad acta ulteriori risorse per complessivi 453 milioni di euro per la prosecuzione dei Progetti Promozionali nel settore del Mezzogiorno Interno, nella Valorizzazione dei prodotti agricoli tipici e nella Forestazione delle zone a rischio idrogeologico della Regione Campania.

Il Commissario ad acta inoltre esercita le competenze su:

• Definizione del contenzioso pregresso ex Agensud;
• Studi di fattibilità finanziati dalla L.208/98;
• Sottoscrizione ed attuazione degli Accordi di Programma Quadro nel settore idrico irriguo;
• Programma PON ATAS di assistenza tecnica ai Dipartimenti Regionali Agricoltura delle Regioni Obiettivo 1 (Q.C.S. 200/2006);
• Pareri su progetti di irrigazione della "legge obiettivo";
• Assistenza Tecnica  e Supporto agli Enti attuatori (Consorzi di Bonifica) di interventi infrastrutturali irrigui.

Riferimenti a delibere, leggi e decreti:

• D.Lgs. n.96 del 3.4.1993 - art.10 comma 6.
• D.L. n.32 dell' 8.2.1995, convertito dalla L.n.104 del 7.4.1995
• L.n. 341/95 art. 15
• L.208/98
• Delibere CIPE n.36/2002, n.41/2002, n.133/2002, n.17/2003, n.20/2004 e n.35/2005